Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Frmpd1A2AKB4 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms