Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Pdpk1Q9Z2A0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pdpk1Q9Z2A0 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pdpk1Q9Z2A0 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Pdpk1Q9Z2A0 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Pdpk1Q9Z2A0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Pdpk1Q9Z2A0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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