Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

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Length 792 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Nek4Q9Z1J2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms