Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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Pfdn5Q9WU28 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
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Pfdn5Q9WU28 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Pfdn5Q9WU28 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Pfdn5Q9WU28 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Pfdn5Q9WU28 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Pfdn5Q9WU28 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Pfdn5Q9WU28 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Pfdn5Q9WU28 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Pfdn5Q9WU28 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Pfdn5Q9WU28 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Pfdn5Q9WU28 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pfdn5Q9WU28 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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