Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Riox1Q9JJF3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms