Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RhojQ9ER71 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms