Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Barx1Q9ER42 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Barx1Q9ER42 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Barx1Q9ER42 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms