Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms