Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fam3aQ9D8T0 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fam3aQ9D8T0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms