Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C6

Med11, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med11Q9D8C6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med11Q9D8C6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms