Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rep15Q9D7T1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rep15Q9D7T1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms