Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Phf6Q9D4J7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Phf6Q9D4J7 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Phf6Q9D4J7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Phf6Q9D4J7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Phf6Q9D4J7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Phf6Q9D4J7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms