Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms