Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rufy3Q9D394 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms