Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms