Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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