Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Susd3Q9D176 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Susd3Q9D176 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Susd3Q9D176 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Susd3Q9D176 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Susd3Q9D176 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms