Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms