Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rpl11Q9CXW4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms