Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prkrip1Q9CWV6 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms