Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Msmo1Q9CRA4 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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