Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms