Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN7

Mrpl41, 39S ribosomal protein L41, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl41Q9CQN7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl41Q9CQN7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl41Q9CQN7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl41Q9CQN7 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl41Q9CQN7 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl41Q9CQN7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl41Q9CQN7 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl41Q9CQN7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl41Q9CQN7 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl41Q9CQN7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl41Q9CQN7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl41Q9CQN7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl41Q9CQN7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl41Q9CQN7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl41Q9CQN7 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl41Q9CQN7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl41Q9CQN7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl41Q9CQN7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl41Q9CQN7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms