Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Nicn1Q9CQM0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nicn1Q9CQM0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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