Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Q9CQC3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Q9CQC3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms