Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Use1Q9CQ56 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Use1Q9CQ56 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Use1Q9CQ56 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Use1Q9CQ56 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Use1Q9CQ56 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Use1Q9CQ56 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Use1Q9CQ56 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Use1Q9CQ56 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms