Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim3Q99PE5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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