Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NsmfQ99NF2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NsmfQ99NF2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms