Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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PtprtQ99M80 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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PtprtQ99M80 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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PtprtQ99M80 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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PtprtQ99M80 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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PtprtQ99M80 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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PtprtQ99M80 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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PtprtQ99M80 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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PtprtQ99M80 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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PtprtQ99M80 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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PtprtQ99M80 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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PtprtQ99M80 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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PtprtQ99M80 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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PtprtQ99M80 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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PtprtQ99M80 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PtprtQ99M80 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
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