Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Usp16Q99LG0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp16Q99LG0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms