Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pagr1aQ99L02 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms