Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Med28Q920D3 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Med28Q920D3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms