Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Usp3Q91W36 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Usp3Q91W36 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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