Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Slc6a20aQ8VDB9 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Slc6a20aQ8VDB9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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