Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SbsnQ8CIT9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms