Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Brf1Q8CFK2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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