Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup88Q8CEC0 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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