Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Lrif1Q8CDD9 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Lrif1Q8CDD9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Lrif1Q8CDD9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Lrif1Q8CDD9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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