Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nhlrc3Q8CCH2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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