Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf428Q8C1M2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Znf428Q8C1M2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms