Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Liat1Q810M6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms