Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Pcsk9Q80W65 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Pcsk9Q80W65 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Pcsk9Q80W65 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Pcsk9Q80W65 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pcsk9Q80W65 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Pcsk9Q80W65 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Pcsk9Q80W65 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Pcsk9Q80W65 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Pcsk9Q80W65 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Pcsk9Q80W65 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pcsk9Q80W65 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pcsk9Q80W65 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pcsk9Q80W65 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Pcsk9Q80W65 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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