Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pnma8aQ80VM8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pnma8aQ80VM8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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