Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Usp8Q80U87 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Usp8Q80U87 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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