Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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