Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp49Q6P9L4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp49Q6P9L4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp49Q6P9L4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp49Q6P9L4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp49Q6P9L4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp49Q6P9L4 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp49Q6P9L4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp49Q6P9L4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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