Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
BC061212Q6P8K3 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms