Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6DFW0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Q6DFW0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Q6DFW0 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms