Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfe3Q64092 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tfe3Q64092 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfe3Q64092 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfe3Q64092 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfe3Q64092 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfe3Q64092 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfe3Q64092 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfe3Q64092 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfe3Q64092 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfe3Q64092 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfe3Q64092 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tfe3Q64092 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Tfe3Q64092 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tfe3Q64092 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms