Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Col4a5Q63ZW6 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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